Aminosäure-Referenz und Übungen zur Peptidnotation
Die 20 Standardcodes, fünf fiktive Datensätze und erläuterte Lösungen. Druckbares Arbeitsblatt und CSV-Referenz unter CC BY 4.0.
15–20 Minuten · Fiktive Lehrbeispiele · Version 1.1
Arbeitsauftrag
- Jeden zugeordneten Rest von N nach C übersetzen. Restfolge getrennt vom Original notieren.
- Endgruppen, Modifikationen und ungeklärte Positionen festhalten. Quellennotation bewahren.
- P1 mit P2 und P4 vergleichen, P1 zählen und die Begründung anhand der Lösungen prüfen.
Codereferenz
A
AlaAlaninC
CysCysteinD
AspAsparaginsäureE
GluGlutaminsäureF
PhePhenylalaninG
GlyGlycinH
HisHistidinI
IleIsoleucinK
LysLysinL
LeuLeucinM
MetMethioninN
AsnAsparaginP
ProProlinQ
GlnGlutaminR
ArgArgininS
SerSerinT
ThrThreoninV
ValValinW
TrpTryptophanY
TyrTyrosinÜbungsdatensätze
| Fall | Datensatz | Frage |
|---|---|---|
| P1 | Gly–Ala–Gly–Lys–Leu–Val; beide Endgruppen ausdrücklich frei | Wie lauten Restfolge und Zusammensetzung? |
| P2 | Ac–Gly–Ala–Gly–Lys–Leu–Val–NH₂ | Was bedeuten die Endgruppenangaben? Ist das dieselbe Form wie P1? |
| P3 | GAM[Oxidation]KLV | Welche Position ist modifiziert? Wie lautet die reine Restfolge? |
| P4 | GAGKIV / GAGKLV | Welcher Rest unterscheidet sich? Reicht die intakte monoisotopische Masse zur Unterscheidung? |
| P5 | GAXKLV | Wie bleibt die ungeklärte Position erhalten? |
Erläuterte Lösungen
- P1. GAGKLV: sechs Reste und fünf verschiedene Codes. G × 2; A, K, L und V je × 1.
- P2. Die Restfolge bleibt GAGKLV. Ac– bezeichnet N-terminale Acetylierung, –NH₂ C-terminale Amidierung. Das sind veränderte Endgruppen, keine zusätzlichen Reste. Die Form unterscheidet sich von P1.
- P3. Die ProForma-Annotation folgt auf Methionin an Position 3. GAMKLV ist die reine Restfolge. Original und Positionsangabe bewahren; der einfache Leser akzeptiert nur Buchstaben.
- P4. Position 5 wechselt von L (Leu) zu I (Ile). Beide sind Strukturisomere mit derselben Elementzusammensetzung. Ist alles andere identisch, unterscheidet die intakte monoisotopische Masse allein diese Sequenzen nicht.
- P5. X bezeichnet einen unbestimmten Rest außerhalb des 20-Code-Satzes. X an Position 3 bewahren und die Zuordnung anfordern. Löschen verändert die scheinbare Länge und verschiebt spätere Positionen.
Hinweise für Lehrende
Eine Spalte für das Original und eine für die reine Restfolge führen. P2 und P3 vergleichen. Prüfen, ob X an Position 3 von P5 als unbekannt erhalten bleibt. Der Leser normalisiert Kleinbuchstaben; D-Aminosäureangaben gehören in das Originalprotokoll.
Quellen und Geltungsbereich
Primärquellen für Aussagen und Notation dieser Seite. Quelldokumente behalten ihren eigenen Geltungsbereich.
Peptide Terms Desk · 1.1 · 12.11.2026 · CC BY 4.0. Originale Lehrtexte und fiktive Beispiele. Quellen Dritter behalten ihre Bedingungen.